2031年，因维人（Invid）抵达饱经磨难的地球，宣布他们对史前能量拥有占有权。这个强大而善战的外星种族武装力量对地球守备军发起了摧枯拉朽般的攻势，在消灭了一切抵抗力量后，占领了地球。得到消息的瑞克·卡特命令远征军（Robotech Expeditionary Force）舰队回航，于是庞大的船团开始转向。在主力舰队到达之前，已有数批先遣队抢先对因维人发动了攻击，然而等待他们的却只有恐怖和毁灭，...

　　未来世界，面对妄图征服地球的外星人，出现了一个阻止敌人入侵的5人团队，为危难之中的人类带来了一线曙光，他们就是“科学忍者队”。 没有任务时五位成员各有工作，以普通人的身份生活。 一旦有异常情况出现，他们就成为无所不能的科学忍者，英勇的守护人类。...